Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q3U6N9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Q3U6N9 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Q3U6N9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q3U6N9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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