Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rnf40Q3U319 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rnf40Q3U319 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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