Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kdm4dQ3U2K5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Kdm4dQ3U2K5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms