Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hace1Q3U0D9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms