Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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