Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms