Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rundc1Q0VDN7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms