Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem52bQ0VBF2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms