Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab42Q0PD08 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms