Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms