Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms