Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Tff1Q08423 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms