Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Sh3bp2Q06649 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Sh3bp2Q06649 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Sh3bp2Q06649 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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