Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs3Q05895 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms