Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Emx2Q04744 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms