Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms