Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb4Q02738 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms