Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms