Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms