Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms