Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms