Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx2P97474 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms