Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cbx1P83917 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms