Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Usp9xP70398 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Usp9xP70398 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Usp9xP70398 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Usp9xP70398 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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