Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms