Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rps29P62274 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rps29P62274 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms