Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp46P62069 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms