Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2kP61087 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms