Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcbp1P60335 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms