Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf5P56477 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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