Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms