Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpdP50404 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms