Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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