Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpreP49446 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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