Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ItgavP43406 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms