Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtgfrP43117 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms