Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sept1P42209 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sept1P42209 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sept1P42209 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sept1P42209 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sept1P42209 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sept1P42209 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sept1P42209 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sept1P42209 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms