Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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