Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Saa4P31532 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Saa4P31532 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms