Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VtnP29788 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VtnP29788 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VtnP29788 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VtnP29788 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms