Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprmP28828 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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