Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms