Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms