Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChgaP26339 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms