Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd8P23463 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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