Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms