Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms