Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PparaP23204 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PparaP23204 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms