Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms