Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms